排水实行雨污分流；养殖废水（猪尿、猪舍冲洗水）经管网收集，进入沼气罐发酵处理，沼液则与生活污水、初期雨水在沼液储存池混合后，部分用于周边100亩农田灌溉，其余则进入污水处理站处理后接管排放。

养殖猪舍：采用干清粪工艺，控制饲养密度、及时清理猪粪，喷洒微生物除臭剂，猪舍内设置机械通风系统采用节水型饮水器等，除臭效率65%。

干粪间：密闭设计+除臭设备+加强绿化及时清运，除臭效率80%。

污水处理站：密闭结构，喷洒除臭剂，加强绿化，除臭效率50%。

沼液储存池：加盖顶棚+投加粉末活性炭+周边绿化，氨气的去除率为13.98%，H2S去除率为90%。

做好隔声降噪措施。

猪粪、污泥、沼渣：送海盐县友邦生物肥料有限公司处置。病死猪尸体、猪胞衣：送海盐卫生处理中心统一处置。废脱硫剂、饲料包装袋、废活性炭：由厂家回收。医疗废物为危废，委托有资质单位处置。生活垃圾由环卫部门统一清运。